ECサイトを始めるなら？小規模事業者のための「選び方」と「おすすめサービスまとめ」
- 智史 長谷川
- 5 日前
- 読了時間: 5分
「ネットショップを始めたいけど、どのサービスを選べばいいのか分からない…」
「会計や決済の管理が面倒そう…」
——そんなお悩みをよく耳にします。小規模事業者や個人事業主の方にとって、コストや操作性、会計との連携まで含めて“無理なく続けられる仕組み”が何より大切です。
この記事では、2025年時点の最新情報をもとに、小規模ビジネスにおすすめのECサイト作成サービスと決済サービスを、freee会計との相性を含めてまとめました。
記事要約
小規模・中小企業向けに使いやすく費用対効果の高い「ECサイトサービス」と「決済サービス」を5つずつ紹介
ECサイトごとの相性のよい業種を紹介
初期費用を抑えながらも、運営・経理効率を最大化できる仕組みづくりを支援
ECサイト・決済サービスの比較ポイント
小規模・中小企業向けECサイト作成サービス 5選
サービス名 | 初期・月額費用 | 特徴 | カスタマイズ性 | freee連携 |
BASE | 無料 | 操作が簡単で初心者向け | △ | ○（公式連携あり） |
STORES | 無料～月額2,980円 | テンプレート豊富、店舗連携も可能 | △ | ○（API連携） |
Shopify | 月額4,140円～ | 多言語・アプリ連携に優れる | ○ | ○（専用アプリ） |
カラーミーショップ | 月額4,950円～ | 日本市場に強くカスタマイズ性高い | ○ | ○（公式連携あり） |
MakeShop | 月額13,750円～ | 集客・販促機能が豊富 | ○ | △（CSV対応） |
決済サービス 5選
サービス名 | 初期・月額費用 | 対応決済 | freee連携 | 決済手数料目安 |
Square | 無料 | クレカ・QR・電子マネー | ○ | 約3.25～3.6% |
STORES決済 | 無料 | クレカ・電子マネー・QR | ○ | 約3.24%～ |
PayPal | 無料 | クレカ・銀行・残高決済 | ○ | 3.6%＋40円 |
GMOイプシロン | 要問合せ | 幅広い決済手段 | ○ | 3.6%前後～ |
SBペイメント | 要問合せ | 多通貨・定期課金対応 | ○ | 要問合せ |
ECサイト別のおすすめ業種は？
BASE（ベイス）
おすすめ業種：ハンドメイド雑貨・アクセサリー、イラスト・デジタルコンテンツ、趣味商品
理由：
初期・月額無料で、在庫数が少なくても始めやすい
デジタルコンテンツのダウンロード販売が標準機能で可能
「誰でも簡単に使える」操作画面が魅力で、専門知識がなくてもOK
SNSとの連携（Instagramショッピングなど）もスムーズ
こんな方におすすめ：副業でネット販売を始めたい個人事業主や、最小限の在庫でニッチな商品を売りたい事業者
STORES（ストアーズ）
おすすめ業種：ファッション雑貨、ベビー用品、カフェ・スイーツのテイクアウト事業者
理由：
店舗販売とネットショップを「STORESレジ」で一元管理できる
予約販売・定期販売・クーポンなど販売機能が多彩
デザインテンプレートが豊富で、商品イメージをビジュアルで魅せやすい
こんな方におすすめ：既にリアル店舗がある小売事業者や、EC初心者で「見た目」にもこだわりたい人
Shopify（ショッピファイ）
おすすめ業種：アパレル・ファッションブランド、化粧品、海外販売（越境EC）を視野に入れる事業者
理由：
多言語・多通貨対応が標準装備で、海外向け販売にも強い
デザインの自由度が高く、ブランドイメージの構築に適している
拡張アプリが非常に豊富で、独自機能やCRM、マーケティングまで幅広く対応
こんな方におすすめ：すでに事業規模があり、本格的なネットショップを展開したい成長志
向の中小企業
カラーミーショップ
おすすめ業種：食品・スイーツ、生活雑貨、地方の特産品販売事業者
理由：
日本の商習慣や税制に対応しており、消費税や送料設定が細かくできる
決済手段が豊富で、代引きやコンビニ決済などにも対応
初期費用はかかるが、長期運用に向いておりコストパフォーマンスが高い
こんな方におすすめ：将来的な事業拡大や多様な商材・販路に対応したい事業者、地元の特産品や食品を販売したい小規模事業者、地域密着型の事業者
MakeShop（メイクショップ）
おすすめ業種：業務用商材・BtoB、家具・インテリア、ギフト・カタログ販売事業者
理由：
BtoB向け機能（掛売り・卸価格設定など）が充実している
高度な商品管理、SEO、販促ツールが標準搭載されており本格運用向け
法人顧客向けの実績が豊富で、サポートも手厚い
大規模展開や複数店舗運営にも対応できる
こんな方におすすめ：商品点数が多い企業や、BtoB・法人向けECを展開する中小企業
freee会計との連携で経理も効率化
小規模事業者に特におすすめなのは、以下のサービスの組み合わせです：
BASE × BASEかんたん決済 × freee：完全無料スタート、自動記帳で手間なし
STORES × STORES決済 × freee：デザイン性と会計連携のバランスが良い
Shopify × Shopify Payments × freee：本格運営・越境EC対応にもグッド
カラーミーショップ × イプシロン決済 × freee：国内中小企業に人気、コストパフォーマンスが高い
freeeとの連携があると、売上・決済・返金・送料などを自動仕訳できるため、記帳漏れ防止と業務効率アップが可能です。
課題に対する活かし方 ～「合う仕組み」を見つけて負担を軽減～
コストの悩み → BASEやSTORESなら無料で始められる
会計が不安 → freee連携機能で自動記帳が可能に
決済手段を増やしたい → SquareやGMOイプシロンとの連携で柔軟に対応
本格運営を目指す → ShopifyやMakeShopの導入で拡張性を確保
導入後の継続性や会計業務まで見据えて選ぶことが、無理なくECビジネスを続けるコツです。
料金や会計freeeとの連携可否などは公式HPで最新の情報を確認してから、もっとも合いそうなECサイトを決めてみてください。